遺伝的アルゴリズムにおける個体集団の多様性をオートエンコーダで分析する手法を示す。従来個体集団の多様性はスキーマや統計量で分析されたが、本手法は遺伝子間の非線形な関係や、集団内に存在する特徴も分析する。これにより、遺伝的アルゴリズムの設計最適化を容易にするなどの展開が期待できる。ベンチマークデータを用いた実験の結果、オートエンコーダの復元誤差と個体集団の多様性の関係について定量的な分析ができることが明らかとなった。