情報処理学会 第84回全国大会 会期:2022年3月3日~5日 情報処理学会 第84回全国大会 会期:2022年3月3日~5日

1ZM-01
タンパク質立体構造の木表現とGCNに基づくEC番号の推定
○青柳詠美,小島正樹(東京薬科大)
当研究室で開発しているVOLTESは、タンパク質の立体構造を、系の自由度に等しい二面角座標を用いて、分子のトポロジーを反映した木構造で表現し、かつデータを6値化することにより、探索対象の構造空間を離散化している。リストの入れ子として実装したアルゴリズムを用いて、これまでタンパク質の論理的構造設計(2019)や
分子進化とトポロジーとの相関解析(2020)に用いてきた。本研究ではVOLTESグラフ構造を特徴量としたグラフ畳み込みニューラルネットワーク(GCN)を用いて、立体構造から反応経路を考慮せずにEC番号を推定し、VOLTESにおけるAIの利用可能性を評価した。