近年ゲノムデータ利用の実用化が注目されるようになったが，各医療機関が保持するゲノムデータに研究者などがアクセス出来るアプリケーションを実現するためには，利用者の問い合わせに応じてクラウドで演算を行う委託システムを用いることが望ましいと考えられる．このシステムにおいてクラウドと利用者との間で相互にデータを秘匿するために完全準同型暗号を用いる秘匿検索手法が研究されている．完全準同型暗号を用いたシステムのパフォーマンスを左右する要素は実験環境や通信プロトコルやだけではなく，システムデザインや用いる暗号スキームなど様々なものがある．本研究では複数の暗号スキームを用いてシステムを実装し比較・分析を行う．