情報処理学会 第81回全国大会講演要旨

1 つの環境中の生物群集が持つ DNA や遺伝子配列の全体は、アルファベット A = { a, c, g, t } 上の文字列の非可換位相半群 A* 上の確率関数として表される。本発表では、A* 上に 1 つの環境中の DNA 配列の集団の時間発展を表す偏微分方程式を導入し、その混合モデルにより DNA 配列の集団に掛かる淘汰圧を表すために導入された A* 上の分布の推定論を展開して、人工的に高塩環境に改変する前後の、広島菜という植物の周辺環境中の微生物群集から収集された 16S リボソーム RNA 遺伝子配列を題材とし、配列の集団の時間発展をコンピューターの中で再現して、解析した結果を述べる。