情報処理学会 第80回全国大会講演要旨

本発表では、高並列汎用分子動力学シミュレーションソフトMODYLASを、名古屋大学設置のスーパーコンピュータFX100システム(以降、FX100)を用いて性能評価を行った結果を報告する。MODYLASの特徴として、ハイパフォーマンスコンピューティング技術を活用して高効率な超並列計算が可能である。我々が設定した性能評価では、名古屋大学のFX100で提供されているTofu2についての4レーン環境と2レーン環境を利用した通信性能の影響を見る評価、および、FX100のハードウェア特徴の一つであるアシスタントコアを活用してMODYLASで現れる通信パターンと通信実装方式に関する性能評価、の2つを対象としている。