2J-03
生体シミュレーションサービスFlint K3における高性能計算に向けて
○永井美穂,置田真生(阪大),安部武志,浅井義之,北野宏明(沖縄科学技術大学院大),萩原兼一(阪大)
Flintは,生体機能解明のためのシミュレータである.
ユーザは様々な生体モデルのシミュレーションを実行できるが,大規模なモデルは計算量が膨大なために実用時間内に結果を得られない.
時間短縮のためにはシミュレーションの並列化が望ましいが,並列実行できる環境にないユーザもいる.
そこで,Flintをクラウド環境で動作させる既存のサービスFlint K3において,シミュレーションの並列実行を可能にし,広くユーザに提供する.
また,既存のFlint K3はバイトコードで実行するインタプリタ形式で実装されているが,ソースコードを生成してコンパイルするトランスレータ形式を取り入れ,更なる高速化を目指す.

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