2H-2
塩基の配置情報を考慮に入れたDNA配列のグラフ表示とその応用
○水田智史，山口恭平（弘前大）
近年，配列決定されたDNA配列のデータ量は劇的に増加している．従って、それ
らを効率良く処理するためには，DNA配列を数値化して数学的に取り扱うことが
必要となってくる．本論文では，DNA配列を数値化し，2次元および3次元のグラ
フで表示することにより，DNA配列間の類似性を目視によって評価することを可
能にする手法について検討する．これまでの同様の研究においては，主に塩基
の情報のみを用いた数値化が行われていたが，本研究では，それに塩基の配置
情報を加えることによってより精度を高めることを目指す．さらに，その結果
を用いてDNA配列間の類似性を定量的に評価する方法についても考察する．